教会办医院主要是基督教、天主教和佛教等。
基督教传入我国，从公元1807年英教士马礼逊起。
鸦片战争后，福州、厦门成为五口通商的商埠，洋人可以自由来我国传教，设教堂、开医院、办学校。英国人孟逊作为海关医生先到台湾，后到厦门，为病人诊疗达二十年之久。教会办医院从接种牛痘开始，然后办诊所、医馆，再后来才是办专科或综合医院。
福建最早的教会医院是公元1860年中华基督教会（美国）在福州创办的“圣教妇孺医院”（即协和医院前身）和公元1866年中华圣公会（英国）在福州创办的福州塔亭医院（即福州市第二医院前身）。上述两家医院都设有护校，是最早在我省介绍和传播西方近代医学。
教会最早在莆仙办医是公元1894年在美国卫理会（基督教分支）蒲星士在莆田涵江创办的莆田麻风院，后来在公元1905年、1906年分别在涵江铺尾、黄石创办了两个麻风院。
公元1896年英国圣公会（基督教分支）福州西议会派雷腾医师（英国）来莆田，先租赁城北坑边大夫祠设立诊所，公元1898年迁址北门街新建院舍，称“兴化圣教医院”（即今莆田学院附属医院），设男女门诊和男女医院（男医院床位四十张，女医院床位二十张），英人雷腾为首任院长。公元1912年，兴化府治取消，改名“莆田圣路加医院”，院长为英人华实博士。
公元1905年美国卫理会传教士普鲁士夫妇在涵江租民房开诊所，之后在紫璜山现址兴建医院，名称“莆田私立兴仁医院”（即涵江区医院前身），自任院长，后聘李可信为院长。
公元1906年美国美以美会（基督教分会）末师姑（美国）与吴德胜腾在仙游县城关创办仙游美以美女医院；公元1937年，莆田圣路加医院华实产科院与仙游美以美医院合办“仙游协和医院”。
此外，公元1920年美国卫理会蒲星士创办的“莆田仁济医院”和英国圣公会创办的“莆田圣路加医院防盲治疗所”因经费不足停办。
教会办医院一直延续到解放初期。之后，人民政府开始刈断外资，接管教会医院。公元1951年，莆田县人民政府首先接办涵江、铺尾、黄石三个麻风院，改名“莆田麻风病防治院”；公元1952年6月仙游县人民政府接管仙游县协和医院，改名“仙游县医院”；同年9月，莆田县人民政府接管莆田私立兴仁医院后，改名“莆田涵江医院”；公元1953年6月，莆田县人民政府接管莆田圣路加医院，改名“莆田医院”，至此，莆田所有的教会医院全部归政府管理，结束了教会在莆仙办医近六十年的历史。（姚益群）