仙游县充分利用森林覆盖率高、少工业污染的自然优势，积极应用现代科学技术，大力推进生态农业发展，取得了显著成效。全县建立了生态农业示范区10个面积16万多亩，现拥有无公害、绿色农产品9个，省级以上名牌农产品20多个，年生产无公害、绿色农产品5万多吨。该县姬松茸出口量占全国的70%以上，乌龙茶出口量占福建省外贸出口量的60%以上。生态农业的发展，促进了该县外向型农业的进一步发展，为 仙游融入大国际市场奠定了良好基础。2009年，该县生态农业产值占农业总产值的65%以上。
该县于2003年成立了仙游县生态农业发展领导小组和办公室，大力实施“生态家园”富民工程和农村户用沼气工程建设，建立生态农业示范基地。通过农村户用沼气池的建设，把改厕、改圈、改厨结合起来，并带动养殖业的发展，实现沼气用户家居温暖清洁化、农业生产无害化、庭院经济高效化，种养业立体化，达到农民增收、农业增效的目的。全县已建有户用沼气池1万多口、大中型沼气工程30多处，走在全国的前头。通过生态农业基地的建设，成功地推广了“猪—沼—果”、“草—牧—沼—果”、“草—菌—肥—稻”等多种生态农业模式，年推广面积8万多亩。
该县切实做好木兰溪、仙水溪、枫慈溪、粗溪等主要溪流2.5-5公里内的畜禽场搬迁和污染源综合治理工作。仙游县在利用山地资源进行综合开发时，做到山头林带帽，山腰果缠身，山脚养畜禽，田中种粮经。山头植林用以保护水源，防止水土流失；山腰种果以利提高经济效益；山脚养畜禽，不但可增加农民收入，而且还能为水果、农作物提供很好的有机肥来源。同时，将畜禽场建在果园中，并配套建设沼气工程，沼气用于果场点灯、煮饭，沼液、沼渣用于就地喷洒、浇灌果树，不但节省果园施肥成本，而且还能有效地提高水果的产量和品质，生产的果品为无公害产品。推广这种模式，一个果场每年至少可节本增收2万元以上。
仙游县把发展循环农业当作推进生态农业发展的一大办法。通过发展循环农业，采取秸秆—饲料—畜禽—粪便—沼气—液肥—施肥—作物”和秸杆—食用菌—肥料—作物等生态循环模式，形成产业链条，实现变废为宝，增加农业效益，促进农民增收。据不完全统计，每年综和利用作物秸秆6.5万多吨，增加农业产值3000多万元，为农民增加收入1000多万元。
仙游旅游资源丰富，有九鲤湖、麦斜岩、菜溪岩、九座寺、三会寺、仙门寺、塔斗山、龙穿城等，但这些单一的景点吸引的游客不多。为充分发挥旅游资源的优势，该县在旅游景点周围配合建设农业生态旅游项目，对旅游区周边的农田冬季推广种植油菜、紫云英等开花作物，成片的油菜花给旅游区增添了一道靓丽的风景线，使景点更加美化、亮化。同时，对旅游区的山头进行统一规划，发展桃花园、李花园、甜柿园、红豆杉园、樱花园等休闲观光园林，现在，钟山、游洋的台湾甜柿、象溪的红豆杉、书峰的百年松和黄金果、社硎的日本樱花已有一定规模。这些生态农业旅游项目为仙游旅游业的发展起到了良好的促进作用，2009年，该县旅游收入比增20%多。 （时报记者 马冰青 通讯员 吴志丹）