自从上世纪80年代中期，台湾当局放松政策后，台湾同胞纷纷回大陆採视，观光旅游，文化交流及学术探讨，进而许多企业家来大陆创办企业，共同走一条经济发展之路。期间，数不清的台湾同胞一批批冲破阻隔回大陆拜谒心中的神祗——妈祖。
一九八七年农历九月九日，台湾大甲镇阑宫妈祖信徒，不畏重重阻碍，绕通日本大阪市，来到莆田湄洲妈祖祖庙参加妈祖诞辰1000年祭庆典，随后来到贤良港拜谒天后祖祠。这是台湾同胞首次来祖祠朝拜妈祖。之后，台胞慷慨解囊，捐资贤良港妈祖祠，先后建起山门，钟鼓楼及亭阁等。1989年，台湾新港奉天宫捐款35万元，建造天后祖祠“迎宾阁”一座。接着，台湾成果鞋业老板刘文彬先生捐资24万元，兴建祖祠碑坊一座。
1991年台湾60艘渔船直航湄洲岛朝拜妈祖，随之也来到贤良港天后祖祠进香拜谒妈祖。两年后台湾大大国际同济令（民间组织），率团来到祖祠，捐资10万元，兴建“同济亭”、“符井轩”。台胞到贤良港捐资建造的诸多建筑物，成为两岸妈祖信众交流的象征。期间，祖祠组织举办“闽台书画展”之次。其中一次是由莆田县文化馆副馆长许庆贤筹备160幅各家书画作品赴台展览。在台湾引起强烈的轰动。同时，天后祖祠也相应举办闽台妈祖文化笔会，莆台知名书画家与大甲镇澜宫董事会人士100多人参加。时任中共莆田市委宣传部副部长许培元和原市文化局局长王武龙主持笔会。此外，天后祖祠董事会先后多次组织人员赴台，参加闽台举行的妈祖文物与史料展。
2001年，台湾大甲镇澜宫、苏澳南天宫、花莲市港天宫发起组成台湾妈祖联谊会，发动全岛妈祖信徒及妈祖宫董事会18家，捐资160万元人民币，在贤良港原妈祖故居旧址，复建“妈祖故居”。这18家天后宫与祖祠结成宫庙单位。期间，台湾大甲镇澜宫董事长颜清标率团2000人盛大进香团来莆田朝拜妈祖，并带来了台湾较有名望的电视台8家来现场直播。莆田市区举行万人踩街游行活动，欢迎台胞来大陆进香朝拜妈祖，反响强烈，意义巨大。
2003年，由台胞和大陆企业家联合捐资35万元，在山亭公路旁，建造“妈祖诞生地”碑坊，又成为一个十分显眼醒目的标志性妈祖建筑物。
2006年9月，由台湾妈祖联谊会会长郑铭坤先生率团组成7000人大型进香团，来到莆田湄洲祖庙、贤良港祖祠及城内文峰宫等，进行为期3天的进香朝拜活动。
总之，20年以来，台胞来贤良港天后祖祠进香朝拜者达200万人次。显而易见，闽台的妈祖文化交流与来往，已成为牵动两岸人民心系祖国和平统一精神纽带，妈祖信仰构成两岸同胞割不断、挥不去的思想支柱，事实证明，两岸人民心连心，根连根。
目前，妈祖城正在紧张地建设当中，许多台胞准备捐资或认购项目，在妈祖城里建造新世纪妈祖文化形象工程，进一步深化妈祖文化内涵，拓宽妈祖文化外延。（郭大卫）