萩芦双亭灵慈妈祖宫位于萩芦双亭村，北连洪南，南接林外，地域广阔，又处在莆永公路，莆田往山区公路的交通枢纽，人丁兴旺。每逢每月初一、十五或逢年过节，灵慈妈祖宫香火鼎盛，灵慈妈祖宫坐北向南，历史悠久，是原莆田县文物保护单位，现由涵江区宗教局管理。据历史记载：灵慈妈祖宫于光绪甲辰年即1904年就有流传。湄洲妈祖自宋代以来就广为流传，屡建护国庇民功德，博得官民崇拜信仰，视为保护神，各地广立庙宇，虔诚奉祀。于建双亭，洪南村民纷纷集资献工献料，择地，于明成祖永乐四年，即公元1406年8月动工，盖起小型灵慈妈祖宫，取名灵慈宫，奉祀妈祖，于永乐5年2月竣工，3月22日往湄洲请妈祖香火，23日回来开光。
小型灵慈宫建成后香火旺盛，每逢春秋祭祀，善男信女来宫拜者接踵而来，甚为拥挤，众说纷纭。于是乡里善男信女决定集资扩建灵慈妈祖宫。明穆宗二年十月动工，翌年4月竣工，4月14日往湄洲妈祖请香火。次日回来，开光告竣，此时因扩大规模宫向改为坐东朝西。
后来因年久失修，宫宇毁坏不堪，而崇拜妈祖信仰日甚一日，每逢祭祀节日，人员拥挤不堪，于是乡老召集各村负责村商定将原来灵慈宫再扩大，并于光绪甲辰年，即公元1904年10月动工，宫宇由单厅扩建为上下厅，添建宫房两间，宫里一切神事用品添置齐全，于光绪丙寅年，即1907年竣工，当年3月初四往湄洲请妈祖香火，初五日回来开工告竣。
解放初期，村里借用宫下厅办灵慈小学，但宫内一切神事用品仍完好无损。“文革”期间，妈祖神像被百姓迁入民宅避难，宫内神像、神事用品被破坏无遗。灵慈宫仅存空宫一座。
1980年，由林天铸等致信新加坡灵慈行宫理事会商讨重兴灵慈宫事宫。至1982年，行宫理事会委派老华侨李亚榜协同天铸等组织灵慈宫董事会，主持重兴灵慈宫事务，并于1985年吉历10月22日举行开光告竣庆典。
1996年为了保存古迹，弘扬妈祖文化，由六境推选18人，组成灵慈宫修建委员会，主持修宫事务。六境群众，妈祖信徒，新加坡侨胞纷纷捐款，并于1996年9月动工，对宫宇进行全面彻底维修。并得到莆田县宗教局支持，申办成立灵慈妈祖宫管委会，并于1997年妈祖节举行授牌授印典礼。1997年10月初四日举行告竣典礼。（马冰青）