嘉靖三十年，林兆恩创立三一教后，公开倡导三教合一论，并锐意终身从事这一活动。起初，没有授徒。过了一段时间，才开始招收门徒。信徒黄州，一向与林兆恩友好，“每详察言动问，心悦诚服，及执贽长跪，愿为弟子受而教”。林兆恩看他立志受业，心意恳切，就收他为第一个门徒，并开始授予他“心法”。随后，黄大本、萧应麟、黄葑、朱廷柱、郑泳、黄阳、黄辉阳、林亹(meacute;n)，以及胞弟兆居、族弟兆诰、兆琼、兆豸等也相继受业，追随林子。
在历史上，任何宗教或学说的创立，都有一个草创和发展的过程，三一教的创立也不例外。林兆恩刚开始创立三一教时，曾遭到戚属宗党和地方官绅的反对和围攻。据《林子本行实录》记载：“时教主倡教，诸戚属宗党多有不率其化丽讪毁之者，教主往往虚心善处而曲全之。”莆田地方官郑一鹏，屡次拜会林兆恩不得见，就写作《莆阳舆议》，大肆攻击嘲笑他。莆田士大夫“谤读言（duacute;）朋兴，见教主所著书多忌之”。他们起初以“好名”嘲笑他，继而以“利口之人”讽刺他。地方乡绅也把三教会一视为叛经离道、惑世诬民的异端。正因为如此，林兆恩为了避免节外生枝，或无中生有，或造谣中伤，在招收门徒时十分小心谨慎，严格挑选。“凡来求教者，教主必稽其素行何如，又须介绍往返数次，然后受之”。
为获得民众的信仰，抵御毁谤者的流言蜚语，林兆恩采取了以“艮背心法”为人治病的手段，来宣传和推行他的学说。起初吸收的三一教徒大多数是“儒林受业者”，他们有一定的文化水准，对宣传、推广三一教起了很大的作用。林兆恩就把“试道妙为却病之方”，对黄州等人说：“此猎较微权也。大道久湮，圣学难明，若不先之以心法之余绪，小试之贫且病者，与夫服药之不效者，将三氏心性之学，骤以语之，谁其信之。故不得已而薄却病以引之，俾知病而可以心法愈之，始信道而可以心法造也。”
林兆恩的“艮背心法”，为什么能为人治好病，也有他的理论依据《林子本行实录》载：“盖以人之病，皆本于心。心病则身病，心不病则身不病。其次又在于气，气逆则病，顺之则不病故却之之法，在持其志。hellip;hellip;从本原上用工夫，非由外铄。夫苟笃信力行，自有能不药而愈病者矣。”
据说，门徒黄州的女儿，不知什么原因，突然变成了瞎子——眼睛看不见了。黄州请教林子，要如何医治。林子把“心法”传授给他，很快就把女儿的眼睛治好——重见光明。乡都宪刘渤，眼睛也有毛病——模糊不清，名医名药，百医无效。黄州求拜林子，林子看刘勋是真心实意要求治疗。就把“心法”授予他，刘勋的眼睛也很快治好了。还有一个姓陈的病妇，无医无药，生命垂危。林子见她家道寒贫，顿生怜悯之心，教给她“心法”，不久也恢复了健康。
林子初试艮背法，治病救人，效果显著，名声载道。那时，求医者“无不随病随却，随叩随应。其起死回生，扶危济厄，悉皆捷于影响者”。他有治病的“迂见”几十条，传授的规矩很严。惟有志学道者，才传授给他；有志立功者，才传授给他。而对那些见利忘义、唯利是图者，拒之于教门之外。
林兆恩教人受持心法，以去除疾病，关键是在于诚心诚意，专心而为。如果三心两意，还想兼治其他的病，那就一定不是诚心诚意。他认为，既然不是诚心诚意，安能心宽?安能根治心病?他又说：“既不能心广根治，体必不胖，面必不啐，至是而日无见其效者，惑之甚矣。盖心为一身之主，或心有惊丽面青，或心有愧而面赤，可概见于此矣。”比如，吐血这一疾病，林兆恩治法与世人相反。世人惟恐其血吐出来，但不过是止留在胸膈。时间长了，淤血更加壅塞，生命就有危险了。林兆恩的治法是先打通患者的胸隔，让淤血都吐出来，然后培养他的根源。这样，就没有治不好吐血的人。又如，医生治病，第一要禁止病人喝酒吃肉。林兆恩却“以酒能行血，肉能生血，不必禁之。惟在勤持心法而已”。他还告戒患病者：“若一心于道，一心于药，则心不专，病安能治?”这就是说，要专心治病，不能心猿意马。
林兆恩遵照明师的教导，把艮背心法“试之以病，病已而人信之”。他的秘方，就是明师传授的真诀：“医者意也，而方固在汝之心矣。”
因为林兆恩的艮背心法，是由九个邃渐深化的修持程序组成，又围绕着“心”这一本体展开，故名为“九序心法”，或“九序”。他又把这套修身养性的方法说成是儒家秘密的“心传法门”，故又称为“孔门心法”。又因为九序心法第一序是“艮背”，或称“九序心法”为“艮背心法”。它逐渐成为林兆恩思想和三一教的重要内容。万历年问，先后编辑成《九序摘言》和《九序内景图》问世。后来，经门徒宣扬和试验，不断得到补充和完善。 （摘自柳滨著《林龙江传奇》）